Reverse Engineering genetischer Netzwerke
Vorträge
Reverse Engineering genetischer Netzwerke. Konzepte und eigene Ergebnisse zur Nutzung dynamischer Expressionsdaten für die Rekonstruktion genetischer Netzwerke
Dr. Dirk Repsilber
Abteilung Molekulare Evolution
Universität Uppsala
Genregulation ist der Kern biologischer Anpassungs- und Entwicklungsvorgänge. In diesem Seminar geht es um die Nutzung dynamischer experimenteller Daten zur Rekonstruktion (Reverse Engineering) der zugrundeliegenden Netzwerke aus regulatorischen Interaktionen, den sogenannten genetischen Netzwerken.
Die Komplexität biologischer Regulationssysteme einerseits und die
Begrenzung der vorliegenden experimentellen Daten andererseits erzwingen
dabei eine Strategie der Reduzierung auf das allernötigste. Zwei
wesentliche Bestandteile dieser Strategie sind:
- die abstrakte Modellierung genetischer Netzwerke
- eine Methodik, welche die Nutzung von biologischem Vorwissen ermöglicht, also Alternativen zum ab-initio-Ansatz
Die Erläuterungen zum ersten Punkt beinhalten eine kurze Einleitung in
das Gebiet, zum zweiten Punkt werden ausserdem eigene Ergebnisse
präsentiert.
Zeit: Freitag, den 22. Februar 2002, 13 Uhr c.t.
Ort:
Institut für Neuro- und Bioinformatik
TZL, Seelandstr. 1a, Geb. 4
Seminarraum S OG.2

